Národní přírodní rezervace Praděd je součástí provincie Česká vysočina, subprovincie krkonošsko-jesenické, podsoustavy jesenické, celku Hrubý Jeseník, podcelku Pradědská hornatina a 2 okrsků: Pradědský hřbet a Vysokoholský.
Pradědský hřbet se nachází v severní části Pradědské hornatiny. Jedná se o členitou hornatinu budovanou horninami pradědské kry desenské klenby a série červenohorského sedla (rulami, fylity, kvarcity, zelenými břidlicemi a migmatity). Nejvyšším bodem je Praděd (1491 m n.m.), dalším významným bodem je např. Malý Děd (1368 m n.m.).
Vysokoholský hřbet leží ve střední části Pradědské hornatiny. Opět se jedná o silně vyzdviženou zlomovou kru s velkými zbytky kryogenně přemodelovaného zarovnaného povrchu s četnými periglaciálními jevy. Tato členitá hornatina budovaná taktéž metamorfovanými horninami (pararulami, migmatity, amfibolity pradědské kry a fylity a kvarcity vrbenských vrstev) dosahuje na území rezervace nejvýznamnějších vrcholů Vysoká hole (1464 m n.m.), Petrovy kameny (1438 m n.m.), Velký Máj (1368 m n.m.).